Die Musikschule wird für das Schuljahr 1968/69 vom Gemeinderat Echternach unter dem Bürgermeister Joseph Relles gegründet. Ungefähr 80 Schülerinnen und Schüler schreiben sich ein und werden von zwei Lehrern betreut: Armand Forthoffer, Dirigent der Harmonie Echternach, unterrichtet die Blasinstrumente, Marcel Weber (†1986) Solfège, Klavier und Violine.

Unterrichtet wird in der damaligen Primärschule. Weil es noch keinen fachlichen Leiter gibt, werden die Geschicke der Musikschule von einer Aufsichtskommission unter dem Vorsitz von Mathias Besenius geleitet. Im Juni 1973 übernimmt Norbert Peffer (†2003) 20 Jahre lang den Vorsitz der Kommission. Nach Norbert Peffer sind André Hartmann, Georges Birgen und François Relles Vorsitzende der Aufsichtskommission der Musikschule. Heute sitzt Dr. Jean-Claude Strasser der Kommission vor.

Im Jahr 1976 ist Norbert Peffer auch Gründungsmitglied der heutigen AEM (Association des Ecoles de Musique du G.D. de Luxembourg), dessen Vorsitzender er bis 2000 ist. Der Vorsitz des Verbandes bleibt weiter bis 2017 in Echternacher Hand mit seinem Nachfolger, dem heutigen Ehrendirektor Marc Juncker.

Vom Schuljahr 1974/75 an findet der Unterricht im „Patregebei“ im Zentrum Echternachs statt. Im neu renovierten und erweiterten Gebäude ist heute das "Trifolion" mit der Musikschule seit dem Schuljahr 2007/2008 wieder beheimatet.

Zu Beginn des Schuljahres 1980/81 wird Marc Juncker mit den Fächern Saxophon und Solfège an die Musikschule berufen. 1982 wird er mit der Leitung der Musikschule beauftragt und vier Jahre später vom Gemeinderat unter Bürgermeister Gab. Delleré zum Direktor der Musikschule ernannt. Durch sein unermüdliches Wirken, seinen Visionen und Ideen hat sich die Musikschule im Laufe der Jahre zu dem regionalen Zentrum für musikalische Bildung weiterentwickelt, das wir heute kennen.

Nach und nach wird die Palette der angebotenen Fächer erweitert und vervollständigt, inklusive klassisches Ballett und Jazz Tanz. Das Angebot wird strukturiert und nach Departements aufgebaut. Es gibt acht verschiedene Departements: Allgemeine Musikkultur (Solfege, Harmonielehre, Musikgeschichte usw.), Gesang, Saiteninstrumente, Tasteninstrumente, Holzblasinstrumente, Blechblasinstrumente, Perkussion,  Jazz - Rock/Pop und Tanz.

2010 übernimmt Marc Demuth (Lehrer für Jazz) die Aufgabe eines "attaché à la direction",  fünf Jahre später tritt er die neugeschaffene Stelle des beigeordneten Direktors an und ist vor allem verantwortlich für den vielfältigen Konzertbetrieb der Musikschule.

Als Marc Juncker sich 2016 entscheidet, bald in Rente zu gehen, wird Nadine Bichler (Lehrerin für Saxophon) als seine Nachfolgerin ernannt. Leider kann sie nach einem Einarbeitungsjahr aufgrund einer schwerer Erkrankung ihr Amt nicht wahrnehmen und verstirbt im November 2017. Nicht nur die Musikschule, die ganze Stadt Echternach und die Luxemburger Musikwelt trauert um Nadine Bichler, die viel zu früh gestorben ist.

Nach einer Vertretungsphase durch Marc Juncker wird Nadine Eder (Lehrerin für Querflöte) 2018 zur Direktorin der Musikschule berufen. Gemeinsam mit Marc Demuth als beigeordnetem Direktor leitet sie seitdem die regionale Musikschule Echternach.

Ende der 80er und Anfang der 90er Jahre bekommt die Musikschule einen stark regionalen Charakter, indem mit den benachbarten Gemeinden Konventionen abgeschlossen werden. Die Musikschule wächst auf jetzt rund 1050 Schüler. Pro Woche finden ungefähr 1800 verschiedene Kurse statt. Über 50 Lehrer und Lehrerinnen unterrichten zurzeit an der regionalen Musikschule. Neben dem regulären Musikunterricht werden zusätzlich viele Ateliers und Workshops mit internationalen Dozenten angeboten. Viele der rund 90 Konzerte, Schülervorspiele und Tanzvorstellungen pro Schuljahr finden aufgrund der überaus guten Zusammenarbeit mit dem Trifolion ebendort statt. Darüber hinaus bereichert die Musikschule das kulturelle Angebot in der Region durch Veranstaltungen in den mit der Musikschule zusammengeschlossenen Gemeinden.

Auch international ist die Musikschule eng vernetzt, so z.B. mit einer Partnerschaft mit den Musikschulen Merzig (Deutschland), Zamberk (Tschechien) und Marx (Russland). Partnerschaftstreffen finden alljährlich in Form einer gemeinsamen Schülerfreizeitwoche mit abschließendem Konzert statt.

Ein weiteres grenzüberschreitendes Projekt ist das Eifel-Ardennen Symphonieorchester, das aus Schülern unserer Musikschule, dem Conservatoire du Nord und der Region Eifel-Ardennen besteht.

2018 feiert die regionale Musikschule ihr 50jähriges Bestehen mit einer ganzjährigen Konzertreihe. Befreundete nationale und internationale Ensembles wie z.B. das Orchester und die Big Band des Militärs, die Brass Band des Escher Konservatoriums, Trombucco, das Deutschen Saxophonquartett und viele weitere Ensembles unter Mitwirkung unserer Lehrerinnen und Lehrer tragen zu einem Gelingen dieses Jubiläums bei.

Heute prägt die Regionale Musikschule Echternach durch ihre starke Präsenz mit Konzerten in der ganzen Region die Kultur im Osten des Grossherzogtums und darüber hinaus.